动物传染病的发生是由于有传染源、传播途径和易感动物的存在。因此，实验动物传染病的防疫原则应该查明并杜绝传染源，切断传播途径，提高动物抵抗疾病的能力。具体措施如下：

1、根据不同等级的实验动物分别制定科学的饲养管理和卫生防疫制度，并严格执行。

2、根据不同等级的实验动物的要求建立合理的环境设施，严格区分实验动物繁育区与动物试验区，且各种动物要分开饲养，以防交叉感染。

3、坚持平时的各项卫生消毒灭菌制度，对实验动物的房舍、用具等定期进行消毒或灭菌，杜绝各种微生物的侵入。

4、力争坚持自繁自养的原则，引进的动物只有确认健康后才能与原设施内动物合群或投入使用，不得从疫区引进动物。

5、外环境定期进行杀鼠灭蝇的工作，防止野生动物和昆虫进入动物饲养室或动物实验室。

6、工作人员定期进行健康检查，患有传染性疾病的人员不能从事实验动物工作。

7、发现疫情及时上报，迅速隔离患病动物，危害性大的疫病采取封锁、扑杀等综合性措施，将患病动物进行焚烧，污染的环境及用具应进行彻底严密的消毒或灭菌。

8、开展经常性的卫生检疫，发现疫情，及时采取相应的防治措施。